新型冠状病毒主蛋白酶-分析方法-资讯-生物在线

新型冠状病毒主蛋白酶

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2020-12-04T00:00 (访问量:4549)

 新型冠状病毒(2019-nCoV)属于单正链的RNA病毒,与SARS-CoV以及MERS-CoV具有较高的同源性,该病毒感染进入宿主细胞后,在宿主细胞的帮助下,其遗传物质RNA的ORF1a/b首先翻译表达出两条多聚蛋白前体(pp1a和pp1ab),多聚蛋白前体在主蛋白酶(main protease, 简称Mpro)和木瓜样蛋白酶(papain like proteases)的作用下发生分子内的切割产生多个非结构蛋白。Mpro也被称为3C-like protease (3CLpro),因为其切割位点的特异性与微小RNA病毒(picornavirus)的3C蛋白酶(3C protease)很相似,两者并称为Mpro/3CLpro。多聚蛋白前体产生的非结构蛋白参与了病毒亚基因RNA和四个结构蛋白(envelope/E蛋白、membrane/M蛋白、spike/S蛋白和nucleocapsid/N蛋白)的产生,进而完成子代病毒的繁衍与释放。由于Mpro蛋白酶在病毒的生命周期中起到了至关重要的作用,且人体内没有同源蛋白,故Mpro主蛋白酶是一个抗病毒药物研发的理想靶点,自2003年SARS爆发后,已有大量基于Mpro结构为基础的抗SARS药物的研究。Lopinavir(洛匹那韦)与Ritonavir(利托那韦)等抗HIV药物也是作用于类似的蛋白酶靶点,并在临床上得到很好的验证。同时,Mpro在beta冠状病毒中保守性高,筛选出的Mpro抑制剂具有一定程度的广谱抗冠状病毒能力,甚至可能用于猪冠状病毒等其它动物的疾病治疗中。
2019-nCoV Mpro/3CLpro与SARS-CoV的Mpro/3CLpro只差12个氨基酸,同源性大于96%,两者结构基本一致。Mpro在介导病毒复制和转录中起关键作用,是病毒的重要的理想的药物靶标。2019-nCoV Mpro/3CLpro是自主研发的PerfectProtein™蛋白表达技术平台纯化而来,由E.coli重组表达,没有任何额外的标签,没有任何一个额外的氨基酸,确保与2019-nCoV病毒的Mpro/3CLpro氨基酸序列完全一致。

产品用途(Applications) 用于新型冠状病毒抑制剂的筛选、酶活性研究或结构研究
外观(Physical appearance) 液体
活性(Biological activity) ≥300U/g或300μmol/min/g
活力单位(Unit definition) 在pH7.0,温度37℃条件下,每分钟催化生成1μmol MCA-AVLQ的酶量定义为一个单位。
浓度(Concentration) ~1mg/ml
纯度(Purity) ≥ 95% by SDS-PAGE.
配方(Formulation) 500mM Tris, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 50% Glycerol, pH7.3。
使用方法(Recommended usage) 用于抑制剂筛选时,一般每个反应体系(200μl)约需要0.2-1μg本蛋白酶。
氨基酸序列(Amino acid sequence) SGFRKMAFPS GKVEGCMVQV TCGTTTLNGL WLDDVVYCPR HVICTSEDML NPNYEDLLIR KSNHNFLVQA GNVQLRVIGH SMQNCVLKLK VDTANPKTPK YKFVRIQPGQ TFSVLACYNG SPSGVYQCAM RPNFTIKGSF LNGSCGSVGF NIDYDCVSFC YMHHMELPTG VHAGTDLEGN FYGPFVDRQT AQAAGTDTTI TVNVLAWLYA AVINGDRWFL NRFTTTLNDF NLVAMKYNYE PLTQDHVDIL GPLSAQTGIA VLDMCASLKE LLQNGMNGRT ILGSALLEDE FTPFDVVRQC SGVTFQ
备注:本氨基酸序列仅供参考,实际氨基酸长度或序列可能有一定变化。
 


1.具体的使用方法请参考新型冠状病毒(2019-nCoV) Mpro/3CLpro活性检测试剂盒,或者自行参考相关文献,根据实验目的,通过实验进行摸索和优化。
2.不同量的2019-nCoV Main Protease(Mpro/3CLpro)酶切 MCA-AVLQSGFR-Lys(Dnp)-Lys-NH2 (冠状病毒蛋白酶荧光底物) (P9731)生成产物的荧光强度参考图1。
图1. 2019-nCoV Main Protease (Mpro/3CLpro)酶切MCA-AVLQSGFR-Lys(Dnp)-Lys-NH2底物的效果图。实际检测结果可能会因样品和检测条件等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。

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