目标区域捕获测序技术,是根据已知特定基因组区域序列设计寡核苷酸探针,通过杂交将目标区域捕获富集进行二代测序。其针对目标区域深度测序,增加了检查灵敏度和准确性。既满足研究需求,又降低测序成本,在科研、临床中均备受关注。
液体处理专家贝克曼库尔特推出Biomek 自动化捕获测序方案,帮助您实现自动化、标准化的捕获测序。 由自动化工作站进行基因捕获,可以减少手工操作时间,提高工作效率,增加结果的重复性和均一性。 Biomek工作站可实现从核酸提取,文库构建,定量混样到捕获的整体实验流程。
Figure 1. 捕获测序文库构建自动化流程
由Biomek成功自动化的杂交捕获试剂盒:
Agilent HaloPlex™ Target Enrichment - Ion Torrent
Agilent SureSelect XT®
Epicentre ScriptSeq® Complete Gold Low Input
Illumina Nextera® Rapid Capture
Illumina TruSeq® Exome
Illumina TruSeq® Rapid Exome
Illumina TruSight® Cancer
Illumina TruSight® Tumor 15
Illumina TruSight® Tumor 170
IDT xGen® Exome Research Panel
NEB NEBNext Direct™ Cancer HotSpot Panel
Roche Nimblegen SeqCap EZ® for Illumina NGS
Biomek自动化捕获测序数据展示
Figure 2. IDT xGen® Exome Research Panel试剂盒捕获测序文库制备。
上图: 片段分析,其中主峰1和2为杂交捕获后cfDNA目标片段峰;
下图:Qubit Fluorometric Quantification核酸定量结果。
Figure 3. IDT xGen®杂交捕获试剂盒历史手工数据vs.
Biomek i7自动化工作站完成数据。A. 平均中靶率,B. 重复率,C. 覆盖度,D. GC偏移。
Biomek向导式软件操作界面
在软件操作界面上用户可以选择样本数量,是否使用台面整合的PCR仪,以及运行工作流程的哪个部分。此外,具备台面自动校对功能,当操作人员完成耗材摆放后,工作站可根据摄像头拍摄,自动判定耗材摆放是否正确,对错误摆放位置进行提示。避免由于人为摆放耗材错误,导致设备碰撞或试剂、时间损失。
Figure 4. 向导式软件操作,IDT xGen® 杂交捕获试剂盒方法选择界面。
Biomek自动化捕获测序——实践速度与通量的飞跃
Figure 5. 完成 24/48/96个样本的自动化IDT xGen®杂交捕获测序文库制备预估耗时。
【直播预告】高维流式数据分析系列课程:从理论到实战——第一期
(暂无发布时间 浏览数:10754)
直播预告-从大规模纯化到标准化检测:外泌体载体成药之路
(2024-09-13T00:00 浏览数:10206)
除了美容,合成生物学还在生活的这些方面帮助我们
(暂无发布时间 浏览数:15636)
实验室自动化:中药研究的创新催化剂
(暂无发布时间 浏览数:14881)
分选技术新突破:纯度与得率的全面提升
(2024-07-29T00:00 浏览数:14172)
团聚细胞计数的应用解决方案:Cell Type参数优化
(2024-07-29T00:00 浏览数:13658)
灭活减毒类疫苗的秘密
(暂无发布时间 浏览数:17286)
纳米流式的解析革命:探索EV“指纹”新视界
(暂无发布时间 浏览数:17748)
自动化助力蛋白质组学样本高质量制备
(2024-07-09T00:00 浏览数:16474)
新版指南解读 | TBNK性能验证及室内质控怎么做?
(暂无发布时间 浏览数:18735)